Авторами главы для автоматизации анализа микроскопических изображений нейронов и их отростков было разработано ПО анализа и распознавания изображений нейронов (ПО АРИН).
Проектирование и разработка архитектуры программы велась в соответствии с общепринятым унифицированным итеративным процессом проектирования UP программной системы, включающим: анализ требований, объектно-ориентированный анализ, проектирование и реализацию разработанных компонентов.
Были выявлены следующие требования к разрабатываемой системе:
1. Алгоритмы автоматического выделения объектов-нейронов должны обеспечивать анализ и распознавание изображений нейронов на двухмерных срезах головного мозга экспериментальных животных.
2. Алгоритмы автоматического выделения объектов-нейронов должны выполняться как на всем изображении, так и на выделенной пользователем области изображения.
3. Автоматизированный анализ изображений нейронов должен проводиться с точностью, соизмеримой с точностью визуального анализа изображений нейронов, проводимого при скрининговом анализе без использования средств автоматизации анализа изображений.
4. В результате работы ПО АРИН должен осуществляться подсчет количества выделенных объектов, выделение их контуров, определение координат центров выделенных объектов, подсчет морфофункциональных характеристик объектов и сохранение этих данных на жестком диске.
На этапе анализа требований к системе было выявлено, что ПО АРИН должна реализовывать следующие процессы предметной области: 1) загрузка исходного изображения; 2) изменение масштаба исходного изображения; 3) запуск алгоритма автоматического выделения нейронов, включающего в том числе коррекцию результатов выполнения алгоритма и сохранение результатов выполнения алгоритма и выделение интересующей области на изображении.
Программа может быть использована при решении задачи оценки степени дегенерации ДА-ергических нейронов в КЧС по разнице в количестве у экспериментальных животных после введения специфического нейротоксина и в контрольной группе.
Программа функционирует на компьютерах типа IBM PC со следующими характеристиками: 1) процессор Intel Pentium III или Intel Core 2c тактовой частотой не менее 2.5 ГГц; 2) объем оперативной памяти — не менее 4 Гб; 3) объем необходимого пространства на жестком диске — не менее 40 Мб; 4) операционная система
— Windows 2000 и выше. Программа позволяет работать с изображениями, представленными в виде файлов следующих форматов: BMP, GIF, JPG, JPEG, PNG и TIFF. Оптимальный размер изображения — 2040×1536.
В состав программы входят:
— ядро, обеспечивающее базовые функции работы с изображениями и матрицами;
— графический интерфейс пользователя, позволяющий использовать функциональные возможности программы и поддерживающий ряд вспомогательных функций;
— пользовательские библиотеки алгоритмов обработки и анализа изображений, необходимые для эксплуатации программы в тестовом режиме;
— модуль генерации отчетов, обеспечивающий вывод, хранение и накопление результатов анализа изображений нейронов в тестовом режиме.
Функциональная схема программы представлена на рис. 14.
Читайте также
Отдых в Джемете — солнце, море, пляж
Джемете — это живописный район на побережье Черного моря, который
Школа профессионального макияжа: искусство создания идеального образа
Дорамы – популярный жанр телевизионного и кинематографического искусства, который нашел
Трудовые споры: как добиться справедливости от недобросовестного работодателя
Трудовые отношения — это тонкая материя, полная нюансов и правовых
Как отличить брендовые очки от подделки
Брендовые солнцезащитные очки — это не только модный аксессуар, но
Дизайн встроенной кухни: как оптимизировать пространство
Несмотря на большое разнообразие готовой (типовой) мебели, мебель на заказ
Михаил Владимирович Мишустин: отличный управленец и экономист
Михаил Владимирович Мишустин — выдающийся российский государственный и политический деятель,
Самые популярные рецепты пиццы: идеальное сочетание ингредиентов для настоящего гурмана
Пицца – это одно из наиболее популярных блюд в мире,
Лето – это время, когда дети, закончив учебный год, уходят
Как получить гражданство Бельгии и что оно дает?
Бельгия, расположенная в сердце Европейского союза, по праву считается одним